從大的意義來說，精選層并不只針對新三板，而且是全面進行金融深改中一個重要的方面，要放在更高層次去看精選層歷史的意義;二是如果從小的微觀角度來看，精選層最大的意義是對于目前新三板中大概接近2000家初具規模的高速成長的企業帶來了一條嶄新的道路，在這條道路上也會給很多企業提供合適的養分、合適的人才、合適的激勵機制。同時在微觀上還有一點，對于券商，包括今天的PE、中介機構也帶來了一條新的道。

　　另一位分析人士認為精選層的推出有兩大意義，首先新三板最大的特點是各個行業“隱形冠軍”目前大部分集中在新三板中，隱形冠軍也是成為中國實業發展非常重要的力量;意義二是，精選層成為新三板互聯國際國內證券市場的通道，該通道隨著時間的推移，會成為一個給滬深交易所、港交所以及其他國際交易所對接的標的，如果市場對接要有好的標的，這個標的就在精選層。